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Un doctorado en física médica le da la oportunidad de investigar un área de especial interés donde la física se aplica para encontrar soluciones médicas. Los temas de proyectos de física médica varían según la institución en función del personal académico disponible para supervisar su trabajo, pero pueden incluir temas como la física de la radiación, las técnicas de medicina nuclear o la resonancia magnética. Así como su investigación muchos cursos incluyen módulos de metodología de la investigación. Su objetivo es producir una tesis que haga una contribución innovadora en el campo, y luego podrá continuar con la investigación o regresar a la industria como un especialista.